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本书介绍基于R语言的生态学数据挖掘原理、方法,内容包括生态学研究范式及数据挖掘基本方法,生态数据的获取、整理、存储和共享,生态学研究常见的空间数据、时间序列数据和网络数据的挖掘以及科学工作流的构建。本书不仅讲述一种新的生态学研究范式和方法,让学生转换一种思维方式,而且有助于提高学生生态文明素养,使其养成“以自然为本”的治学态度。本书适合生态学专业的高年级本科生和低年级研究生使用。
刘方邻,博士,研究员,中国科学技术大学兼职教授。1990年毕业于安徽师范大学生物系动物专业,1999年在 西双版纳热带植物园获生态学硕士学位,2004年在 上海生命科学研究院/植物生理生态研究所获动物学博士学位。先后在中国林业科学研究院资源昆虫研究所、 西双版纳热带植物园、 合肥物质科学研究院单位工作,主要从事生态信息学与昆虫-机器混合社群有关研究。
序
前言
第1章 生态学研究及其范式
1.1 生态学之问
1.2 生态学研究范式
第2章 R语言与数据挖掘
2.1 R语言及程序包
2.2 大数据与机器学习
2.3 数据挖掘初步
第3章 多源异构数据获取与管理
3.1 问题与数据
3.2 数据组织与整理
3.3 数据存储与共享
第4章 探索性数据分析
4.1 数据表与转换
4.2 多元分析
4.3 ade4包
第5章 空间数据与云计算
5.1 空间数据与表达
5.2 区域特征构建
5.3 RFsp与云计算
第6章 时间序列探索与建模
6.1 时序数据及表达
6.2 时序预测建模
6.3 时序相似性度量
第7章 生态网络与图挖掘
7.1 网络数据表达
7.2 网络构建与特征
7.3 网络扰动与预测
第8章 科学工作流
8.1 工作流及构建平台
8.2 构建和发布工作流
8.3 一个简单工作流构建举例